خلال حرب 1948، التحق العديد من أبناء صفورية بالقتال في قرى الجليل الأخرى لمنع سقوط هذه القرى بأيدي القوات اليهودية، وبالتالي إيقاف تقدمها باتجاه صفورية.

احتلت صفورية خلال عملية ديكل، التي قادها بن دانكلمان، والتي كانت أكبر هجوم يهودي في شمال فلسطين، بهدف دفع الناصرة إلى الاستسلام.

قُصفت صفورية من قبل طائرات إسرائيلية، في 15 تموز 1948، مما سبب الرعب بين السكان.

سقطت صفورية بأيدي القوات الإسرائيلية في 16 تموز 1948 بعد قصف عنيف من الطيران والمدفعية، استشهد فيه العشرات. وقد دافع عن القرية بعض متطوعي جيش الإنقاذ، وبعض المقاتلين المحليين، وبعض جنود الجيش السوري.

فرّ معظم سكان القرية باتجاه الشمال نحو لبنان، ولم يبق سوى حوالي 400 شخص في القرية.

كان لسقوط صفورية أثر مروع على سكان الجليل، الذين رأوا فيه نهاية مأساوية للحرب. لذا سقطت معظم القرى المتبقية دون قتال.

في مساء 16 تموز 1948 استسلمت الناصرة للإسرائيليين بعد قتال خفيف.